三年前新村贡使团在返回途中遭遇风暴，包括张一山，陈千林在内的一百多人全体遇难；爪哇贵族因不满丢失巴厘岛控制权，趁使团下落不明，四海军和大明水师大部出海寻找，陈家全部人回到老宅等待消息之际，屠灭新村陈家满门。
消息传来，留在南京的一众南洋人皆悲痛不已，大嫂更是数次寻死，后来因为张玲要挟要随母而去才肯罢休。陈千河要回南洋报仇，逃离御营差点被枭首示众，又是张洋小四求到太子才得以免死，继承巴厘县伯之位，张洋也靠着兄终弟及继承了海隐县伯。
明廷震怒，永乐帝下旨斥责，要求爪哇划巴厘岛、马都拉岛、新村、海隐岛、祖岛、新岛、及周边海域为汉人自治领，由大明派兵保护，否则必大军讨伐，爪哇王室岂敢不从，遣使告罪，立下盟约永世安分守界，不犯自治领分毫。
大明吴兴自治领建立，含永宁港（新村港）、栖瀛岛（巴厘岛）、望川洲(马都拉岛)、海隐岛、祖岛、新岛各岛彼此相连的广阔海域，于此地界建制确立专属汉人自治疆域。此地名义属于爪哇，境内各级文武官员皆由朝廷选派与地方推荐产生，当地政务民生、海路防御悉数由自治都指挥使司（大明）全权执掌。四海军也同时并入大明南洋水师，驻守自治领，巡防海域。自治领为吴兴郡主（赵佳）领地，遣侯显为镇抚太监，侯显成了自治领实际最高控制者。
同时翻出之前郑和他们回来时从走私海匪拿到的口供，开始在沿海严查走私。一南一北把走私通道死死卡住。
明历43年（永乐八年）六月初，已改名为海军的大明水师借口海军首次出航访问倭国，从南京出发。途经济州岛，以补给为由靠岸上岛，并提前通知朝鲜太宗李芳远来见。在欢迎宴会上，郑和隐晦的提了永乐帝对倭国不满，对马岛倭寇经常袭扰大明，这次就要将其拿下，震慑倭国，但大军缺乏补给基地，想要借济州岛一用；李芳远闻言大喜，便是只要天朝对倭作战需要，济州岛想用多久用多久，朝鲜还可派兵四万，舰船一百三十艘，协助作战。随即与郑和签下济州岛租借法案，朝鲜撤出岛上官员，大明可使用岛上一切人力物力对倭作战，租借时间直至对倭作战结束。
在访问舰队抵达对马岛时，借口舰队丢失御种母猪三头，派遣朝鲜军队上岸搜寻，与倭人武士发生冲突，死伤数十人。郑和大怒，随即发兵打下对马岛；搜查守护官署，发现石见银山详细资料，部分矿石和银锭样品；寻获御种母猪尸体。
上报京师后，永乐帝大怒，下旨训斥倭国，命郑和攻下石见银山。
收到命令，郑和先将对马岛倭人俘虏，居民尽数调用朝鲜船只运往济州岛，还送了不少给李芳远。将对马岛作为明军攻占石见银山的桥头堡，开始对倭作战，《济州岛租借法案》，同时生效。
明历43年十月，石见银山及其周边已被大明和朝鲜仆从军把控，同样将十几万倭人发回济州岛，许以厚利招募济州岛朝鲜民众到石见开矿采银，抓捕倭奴。这就是后世历史着名的石见藏银事件，标志着大明对外殖民掠夺的开启。
明历43年十二月，为参加新年大朝会的郑和从石见返回大明，同时带回粗炼白银220石（吨），震惊朝野。
明历44年（永乐九年）正旦大朝会上，永乐帝一口气说出停止迁都，还是称为北平；北地军屯，改游为圈，废除缠足，推行大明标准度量衡，文字改革，以明历纪元几大措施，要求各部推行，工部军器局、火药厂、盔甲厂一同并入精器营，工部不再涉及军用物资生产。在美洲这个大压力面前，各条措施在永乐帝的强势下早已通过，今天只是借这个机会昭告天下，史称“永乐大改”。
最后大朝会以大明天轨落成典礼结束，天轨御道尽头就是一个巨大的日冕，刻在广场之上。
大明第一个三年计划开始实施。
明历44年，北方诸岛和北海道虾夷人遣使大明立藩上贡，正式脱离倭国掌控，成为大明独立藩属国；大琉球袭扰倭国九州岛，明廷派使谴责，要求将捕获倭人送至小琉球及海南岛进行人道救助，大明会派海军协助，租借琉球（冲绳）岛为海军基地。
这年大明军队四出，对火器需求大增。精器营解决了锰钨镍矿石粉碎工艺，可以直接添加，加上少量提炼出铬、粗铝等金属，已经能够少量生产弹簧钢、工具钢、轴承钢，老式手工机床性能大增，随即开始生产滑膛燧发枪，长身管炮提供禁军换装，产能不足，只能将要求较低的火绳枪和老式滑膛炮、子母炮（弗兰机炮）制造图纸交给各地卫所和宣慰司自行生产装备。
煤炭、钢铁、舰船需求激增，北方依靠政策扶持，资源优势，加上石见银矿提供财政支持，军屯集团提供大量粮食肉食，皮毛筋腱等物资，开始了以国有方式的矿山、铁厂、船厂的大建设。一条条黑色的煤渣路、矿渣路，在北方平原上蔓延伸展，一辆辆四轮马车在上面运送着海量物资到河港码头；一艘艘驳船在江河上列队而行，到达海港再转运海船直下江南，南北之间互通有无。
南方同样以粮食、药物、布匹、工具等物，吸引大量山民苗彝壮瑶等少数民族下山归附，对于那些罔顾不化的头人土司，正好成了锦衣卫特战营的练兵对象。云南、贵州、四川、广西各地纷纷改土归流，各族杂居不分彼此。草药，茶叶，山货，源源不断的充实着大明各处商行店铺。
同时朝廷严令汉夷一体，只要是编入民籍之人，同工同酬，同罪同罚，不问民族信仰，只看是否违例，不得有任何歧视偏见。
这也是后面大明直接取消户籍制度的主要原因，当时边民入籍，在永乐帝和革新官员的故意疏忽下，只分了民籍和军籍，并未再细分农、工、商、贱。