元始天尊与孔宣联手，重创破军，逼退了这尊混沌魔神，也将魔化的蚩尤，彻底打垮，生擒在了涿鹿之野。
可战争，并没有就此结束。
蚩尤虽然被生擒，可他麾下的九黎大军，还有八十一个魔化的兄弟，依旧占据着南方的大片土地，很多死硬的九黎部落，依旧负隅顽抗，甚至想要组织兵力，前来涿鹿，救回蚩尤。
更重要的是，经过了数年的战乱，整个人族四分五裂，九州部落联盟名存实亡，各个部落之间，猜忌重重，矛盾不断，哪怕蚩尤已经被生擒，依旧没有形成统一的力量，随时都可能再次陷入内乱之中。
有熊部落的大营之中，年仅十七岁的公孙轩辕，看着眼前的局面，心中清楚，想要让人族真正恢复安定，结束战乱，光靠生擒蚩尤，是远远不够的。
他必须做两件事：第一，彻底平定九黎部落的叛乱，结束这场持续了数年的战乱；第二，联合整个人族的所有部落，建立一个统一、稳固的联盟，制定统一的规则，让人族真正凝聚在一起，再也不会因为分裂，而陷入战乱与危机之中。
而这两件事，都需要他，用自己的力量，去完成。
第二天一早，轩辕就召集了所有前来投奔他的部落首领，还有联盟的所有将领，在大营的明堂之中，召开了大会。
看着下方数十个部落的首领，还有身经百战的将领们，轩辕站起身来，目光扫过众人，声音沉稳而坚定，传遍了整个明堂：
“诸位，蚩尤作乱，已经有数年之久。这数年里，我们人族，无数百姓死于战火与屠戮，无数家园被焚毁，无数良田被荒芜，无数亲人阴阳相隔。”
“如今，蚩尤虽然被我们生擒，可战乱依旧没有结束，九黎的残余势力，依旧在负隅顽抗，我们的族人，依旧在受苦。更重要的是，经过这场战乱，我们人族四分五裂，人心涣散，若是不能重新凝聚在一起，未来，还会有第二个、第三个蚩尤出现，我们的族人，还会再次陷入战乱与苦难之中。”
“今日，我轩辕在此立誓，定要带领大家，彻底平定叛乱，结束战乱，统一人族，建立一个安定、团结的人族联盟，让我们的族人，再也不用受战乱之苦，再也不用流离失所，安居乐业，世代传承。”
“愿意跟随我轩辕，一起平定战乱，守护人族的，我轩辕，定当与他生死与共，祸福同担！”
轩辕的话音落下，明堂之中，瞬间安静了下来。
众位部落首领，看着眼前这个年仅十七岁的少年，眼中满是震动。在这数年的战乱之中，他们亲眼看到了轩辕的仁德、智慧、还有勇气。他始终站在抵御蚩尤的最前线，哪怕是在最危急的时刻，也没有放弃过任何一个部落，任何一个百姓。
他救了无数人的命，也护了无数部落的周全，在整个人族之中，有着极高的威望。
“我愿意跟随轩辕首领！”第一个站出来的，是曾经被蚩尤攻破部落，全家都被轩辕救下的有乔氏首领，他跪倒在地，对着轩辕，高声道，“轩辕首领仁德无双，智勇双全，只有您，能带领我们人族，结束战乱，走向安定！我有乔氏，愿奉轩辕首领为联盟共主，唯命是从！”
“我也愿意！”
“我神农氏部落，愿奉轩辕首领为共主！”
“我陶唐氏部落，愿跟随轩辕首领，平定叛乱，守护人族！”
一个个部落首领，纷纷跪倒在地，高声呼喊，愿意奉轩辕为联盟共主，跟随他平定叛乱，统一人族。
就连那些之前摇摆不定，甚至曾经归顺过蚩尤的部落首领，也纷纷跪倒在地，表达了自己的归顺之意。他们知道，只有跟着轩辕，人族才有未来，他们的部落，才有活路。
看着跪倒在地的众位首领，轩辕心中百感交集，他对着众人，深深躬身回礼，眼中满是坚定：“诸位放心，我轩辕定不负大家所托，定当护持人族，护持每一个部落，每一个百姓！”
就这样，以轩辕为核心的人族联盟，正式建立了起来。上百个人族部落，尽数归顺，形成了一股统一的、强大的力量，结束了之前四分五裂、人心涣散的局面。
建立联盟之后，轩辕做的第一件事，就是整顿军队。
他从各个部落的青壮之中，挑选出了精锐的士兵，组建了一支统一的联盟大军，分为十路，分别由身经百战的将领统领，制定了严格的军规军纪，进行了严格的训练。同时，他还让部落里的能工巧匠，打造了大量的兵器、甲胄、战车、弓箭，提升大军的战力。
第二件事，就是安抚百姓，恢复生产。他派出了大量的人手，前往各个受灾的部落，救助流离失所的难民，分发粮食、衣物，帮他们重建家园，开垦荒地，恢复耕种，让百姓们重新安定下来，也为大军提供了充足的粮草保障。
第三件事，就是制定了联盟的规则，明确了各个部落的权责，化解了部落之间的矛盾与恩怨，让整个联盟，变得更加团结，更加稳固。
短短三个月的时间，轩辕就将整个联盟，打理得井井有条。联盟大军，训练有素，士气高昂，粮草充足，战力强盛；各个部落，安定有序，百姓们安居乐业，人心凝聚，整个联盟，焕发出了前所未有的生机与力量。
而在这三个月里，九黎部落的残余势力，也发生了内乱。蚩尤被生擒，破军被重创逃窜，群龙无首，八十一个兄弟之间，为了争夺首领之位，互相攻伐，内斗不止，势力越来越弱，很多原本归顺他们的部落，也纷纷倒戈，前来归顺轩辕的联盟。
轩辕知道，决战的时机，已经成熟了。
这一日，轩辕在涿鹿之野，举行了誓师大会。
数十万联盟大军，列阵于涿鹿之野，军容严整，士气高昂，旌旗遮天蔽日，喊杀声震彻云霄。
轩辕身着铠甲，手持轩辕剑，站在高台之上，看着下方的大军，高声誓师：
“将士们！数年来，蚩尤作乱，屠戮我们的亲人，焚毁我们的家园，让我们的族人，陷入了无尽的苦难之中！”
“今日，我们就要出征，彻底平定九黎叛乱，斩杀首恶，结束这场战乱！为我们死去的亲人报仇！为我们的族人，打出一个和平安定的未来！”
“将士们，随我出征！”
“出征！出征！出征！”
数十万大军，同时发出了震天动地的呼喊，声音如同惊雷一般，传遍了整个涿鹿之野，传遍了整个人族大地。
誓师大会结束之后，轩辕亲自率领着数十万联盟大军，兵分三路，朝着九黎残余势力的核心地带，发起了全面的进攻。
战争，几乎没有任何悬念。
轩辕的联盟大军，士气高昂，训练有素，指挥得当，而九黎的残余势力，内斗不止，人心涣散，根本无法抵挡联盟大军的进攻。
联盟大军一路势如破竹，接连攻破了九黎的数十个据点，收复了所有被占领的部落，九黎的军队，要么望风而降，要么一触即溃，根本没有任何反抗之力。
短短一个月的时间，轩辕就带领大军，扫平了所有的九黎残余势力，收复了南方所有的土地，将蚩尤的八十一个兄弟，尽数擒获，彻底平定了叛乱。
最终，轩辕带领大军，回到了涿鹿之野。
在这里，他要与被生擒的蚩尤，做最终的了断。
涿鹿之野的校场之上，数十万联盟大军列阵，无数人族百姓，从四面八方赶来，围观这场最终的审判。
蚩尤被押到了校场中央，他已经从昏迷中醒了过来，体内的魔气，已经被孔宣彻底镇压，恢复了神智。他看着校场之上，人山人海的人族百姓，看着高台上的轩辕，眼中满是复杂的情绪，有不甘，有悔恨，也有释然。
轩辕站在高台之上，看着下方的蚩尤，高声宣布了他的罪状：屠戮同族，霍乱人间，勾结魔神，残害百姓，罪大恶极，天地不容。
最终，轩辕下令，在涿鹿之野，斩杀蚩尤，以祭奠那些死于战乱的无数人族百姓。
随着轩辕的一声令下，刀斧手手起刀落，蚩尤的头颅，被斩落于涿鹿之野。
随着蚩尤被斩杀，这场持续了数年的战乱，终于彻底结束了。
校场之上，数十万大军，无数百姓，同时爆发出了震天动地的欢呼，声音响彻云霄，传遍了整个人族大地。
无数百姓，跪倒在地，对着高台上的轩辕，高声呼喊着：“轩辕首领万岁！人族万岁！”
在所有人的拥戴下，公孙轩辕，正式成为了人族唯一的共主，号黄帝。
而这场决定人族命运的大战，也被永远载入了人族的史册，史称——涿鹿之战。