神秀抬手示意安静，继续说道：“既如此，我来说说接下来的工作重点。第一，是赈灾，还有很多同胞现在没房住。来人，把猿飞日斩的直属暗部大和抓来，让他建房子戴罪立功。”
“第二，木叶需要重新规划，扩大，再招收一批村民。第三，对于以三代为首的犯罪集团要进行倒查，从现在起对猿飞、志村、转寝、水户门四族进行封锁，调查其犯罪人员。第四，四代目的葬礼以及火影继位典礼。这些奈良鹿台和宇智波富岳一起操办，散会！”
奈良鹿台欣喜若狂，他赌赢了。以后什么狗屁的猪鹿蝶，他要族谱单开，创立一个新的家族。
众人散去，自来也还呆呆的坐在那里。似是不敢相信这个事实，不到一天时间，他的师傅和弟子全都死去。神秀走到他身前说道：“木叶的事情你少管，你爱追纲手追纲手，爱找大蛇丸找大蛇丸。没有清算你算是对你最大的保护了，你别以为他们只做了这点事情。你的师傅设计害死你得弟子，团藏害死了你在雨之国收的其他学生，真的是有意思啊。”
之后众人就没有在注意自来也，只是听人说他在参加完葬礼之后就离开了木叶。最后没过多久就死在了雨之国，拜托蛤蟆传回来一些没啥用的情报。
专案组调查木叶F4，发现他们四人恶贯满盈，所犯罪行罄竹难书
不仅涉及数十起针对平民及忍者的非法人体实验，更在任期间通过伪造任务记录、挪用赈灾物资、暗杀政敌等手段排除异己，累计造成上百名无辜者死亡或失踪。
其中，仅猿飞日斩默许的“根部特别清理计划”，就以“叛忍嫌疑”为名秘密处决了数十名有潜力威胁其统治的年轻忍者；团藏主导的“写轮眼适配实验”，更是将十余名宇智波俘虏活生生折磨致死，只为培育出嵌合度更高的“写轮眼+木遁手臂”。
转寝小春与水户门炎则利用分管财政与档案的便利，系统性销毁了这些罪行的关键证据，并将相关资金转移至家族秘密账户，其账本记录显示，近十年来流向四族私人产业的“不明支出”高达数千亿两，相当于木叶六年的预算总和。
有两百多名涉案颇深的罪犯被直接处死，苟活着的志村团藏、转寝小春、水户门炎被幻术控制着每天在火影大楼前磕头，忏悔自己的罪孽，直到油尽灯枯。
磕头行动几乎迎来木叶所有人围观，那些受害者家族肆意打骂他们发泄着心中的不满。磕头仪式整整持续了七天，七天后三人被凌迟处死，合着猿飞日斩的骨头渣滓直接烧了扬了，真正意义上的挫骨扬灰。而他们所做的事情要被编入教科书，一代一代的传下去。
神秀还命人制作木叶F4跪着的铜像，跪在慰灵碑前一直忏悔。这几尊铜像三天两头被破坏
而那些罪行较轻或被胁迫参与的边缘人员，则被剥夺忍者身份，废除查克拉。接下来就是火影继位仪式和追悼会，火影继位仪式与四代目追悼会合并举行，木叶隐村万人空巷，气氛庄严肃穆中带着一丝对新时代的期盼。
慰灵碑前，白色的菊花如海，四代目夫妇的黑白照片悬挂中央，照片上的波风水门笑容温暖依旧，玖辛奈则带着几分泼辣的温柔。
宇智波神秀身着火影袍，站在高台上，目光沉静地扫过下方密密麻麻的忍者与村民。他没有过多的华丽辞藻，只是声音清晰地讲述了水门夫妇为保护村子所做出的巨大牺牲，以及猿飞日斩集团的罪行。
当提到那些被掩盖的真相和逝去的冤魂时，台下许多人泣不成声。神秀亲自为水门夫妇献上花圈，深深鞠躬，随后转身面向众人，正式接过象征火影权力的斗笠。
神秀正式担任火影的第一天，猿飞、志村、转寝、水户门四大家族族长就来面见神秀投降，表示愿意配合火影大人一切行动。无论付出什么代价，只求之前事情能够翻篇。
神秀思索过后表示，由于猿飞日斩、志村团藏、水户门炎和转寝小春四人做的事情已经天怒人怨。很多人对你们不满，扬言要灭你们四族，你们四大家族在木叶已经待不下去了。不过神秀大人仁慈，看不得众生疾苦，愿意给与你们一条活路。
接着拿出一卷规划书，详细规划了木叶马上要着手开发涡之国，重建涡潮村，你们四族可以搬去涡之国生活。并且宇智波一族和自己派系大多数人都会去，不必担心是单纯的流放。
四大家族族长感恩戴德，神秀却表示你们吸木叶这么多血，木叶F4又把一切搞的一团糟，你们总要表示点什么。
四族族长请神秀大人明示，神秀说涡之国现在有部分活不下去的叛忍，实力不强，就是比较分散，很麻烦。需要你们去将他们剿灭，既是投名状，也是凭借此功进驻涡之国。
四人不疑有他，回去点齐兵马杀向涡之国。到了涡之国他们就傻眼了，哪里是普通的叛忍，是破坏了砂隐的无天带着角都和蝎还有一大堆强力叛忍，四族忍者被打的全军覆没。
神秀闻言大怒，发誓要为木叶同胞讨回公道。于是带上人打败了无天，扫平涡之国的叛忍土匪，重建涡潮村。而战败后的无天不知所踪，没有编制的叛忍们被晓组织接收。
涡潮村的重建工作在神秀的主持下有条不紊地展开。宇智波族人作为先锋，迅速规划好了村子的布局。大和则在神秀的“亲切关怀”下，没日没夜地发动木遁，一栋栋崭新的房屋拔地而起，街道宽阔整洁，中心广场上甚至立起了一座神秀大人的雕像和纪念碑，碑上刻着神秀亲笔题写的“海纳百川，有容乃大”八个大字。
对于神秀重建涡潮村，云隐岩隐和雾隐很不满，他们派了不少人来试探，都被狠狠地打了回去。神秀也派了不少人去他们境内“做客”，几方经过两年多不断拉扯，各方也就默认了这个行为。
转眼又是一年过去，宇智波正按部就班的发展。佐助和鸣人也到了可以修炼的年纪，这两小只从小吃的好锻炼的好，身体素质挺不错。神秀给他们同龄人两倍的训练量也能坚持很好的完成，并且只要休息好了又能生龙活虎。